Нашёл причину появления пятен при формовке. Кожа в порядке, плесень совершенно не при чём. Всё намного проще и банальнее.
Я крепил край кожи гвоздиками... а на них была ржавчина, которая при посредстве моих рук попадала на кожу и там появлялись пятнышки. Понятно, что при замачивании кожи БЕЗ гвоздей

всё было чистенько...

Вывод: не использовать в процессе формовки РЖАВОЕ железо!