Лучше настроить компьютер на синхронизацию с сервером точного времени. Непосредствено перед проверкой синхронизировать. Сам всегда так проверяю. Даже если точно идут, секунды все равно вылезут. Сигнал по радио может быть менее точен. Вообще, такая скромная механика не может так точно ходить.