На самом то деле зачем кодировать сигнал или вырубать систему????
Достаточно вводить смещение на пару градусов с установленным временным алгоритмом и все, ракеты летят соседу (если в основе наведения заложен только GPS, но как правило это не так, как минимум еще несколько систем наведения в резерве).
В этом вопросе нас могут просветить товарищи из РЭБ или ракетчики, если таковые имеются на форуме.

Произойдет то, что гражданские пользователи обеих сторон, смогут своими "мобильными телфонами" колот орехи, так для них будет режим тишины.
В частности дядюшка Сэм будет работать только на себя.